侍中杨再思、中书令李峤都依从宗楚客的意思，来使魏元忠致罪，惟有中书侍郎萧至忠主张对魏元忠从宽原宥。宗楚客大怒，又派给事中冉在雍与杨再思再上奏，说：“魏元忠既有叛逆罪的嫌疑，不适合授内地官。”于是魏元忠又降迁思州务川县尉。过了不久，宗楚客又令御史袁守一上奏：“则天皇帝过去在三阳宫有疾，内史狄仁杰奏请陛下监国，魏元忠秘密进言说不可。

据此，就可以知道魏元忠怀叛逆之心由来已久，伏请从严加罪诛除。”中宗对杨再思等说“：我想这件事，这是袁守一的大错，人臣忠于主上，必在一心，哪里有主上稍有不安，就请出太子来主管国事的?这实际上是狄仁杰私心讨好，并不是魏元忠有什么过失。袁守一假借前事来给魏元忠罗织罪名，这哪是什么判罪的道理。”宗楚客等到此才算罢休。魏元忠到涪陵去世，享年七十余岁。

景龙四年(710年)，追赠魏元忠尚书左仆射，齐国公、本州刺史，又令把他的灵柩送回老家安葬;李旦即位，又亲旨令魏元忠遗骸陪葬定陵。景云元年(710年)，又降旨：“故左仆射、齐国公魏元忠，代合众望，可称得国之贤良。他历事三朝，都极忠诚干练，晚年遭贬谪，并不是他有罪。应当按功归还他的儿子著作郎魏晃实封一百户。”开元六年(718年)，谥曰贞。